平安 · 寺院 · 國寶
中尊寺
岩手縣 平泉町
金色堂由奧州藤原氏初代藤原清衡於1124年建造，內陣以夜光貝螺鈿和金箔裝飾，供奉阿彌陀如來，須彌壇中長眠著藤原氏四代。這是唯一保留中尊寺創建時原貌的建築。
桃山 · 寺院 · 國寶
瑞巖寺
宮城縣 松島町
在瑞巖寺，可以在伊達政宗於1609年建成的國寶本堂中，觀賞飾有隔扇畫的各個房間和御成玄關；在相鄰的國寶庫裡，則可看到雄渾的唐草雕刻和設有排煙樓的大屋頂。
室町 · 寺院 · 國寶
羽黑山五重塔
山形縣 鶴岡市
這座高29公尺餘的五重塔不施彩繪、保留原木本色，矗立在羽黑山杉樹林立、石階綿延的表參道上。塔建於1372年，與出羽三山信仰之山的參道景色融為一體。
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輪王寺大猷院
栃木縣 日光市
在輪王寺大猷院，可以看到作為德川第三代將軍家光廟所而建、以金色和黑色為基調的國寶靈廟（拜殿·相之間·本殿），以及依次穿過仁王門、二天門、夜叉門的參道。境內排列著315座燈籠，在靈廟內部還能看到狩野探幽的唐獅子和天花板上的龍圖。
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圓覺寺
神奈川縣 鎌倉市
在圓覺寺，可以看到以扇椽屋簷之美著稱的禪宗樣舍利殿（國寶），以及關東最大梵鐘、國寶洪鐘。寺方的活動日程中，每年安排三次舍利殿特別公開。
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瑞龍寺
富山縣 高岡市
在瑞龍寺，可以漫步於總門、山門、佛殿、法堂排成一直線並以迴廊相連的江戶初期禪宗伽藍。國寶為文政元年重建、高約18公尺的山門，覆鉛瓦的佛殿，以及供奉前田利長牌位的法堂共3棟。
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善光寺
長野縣 長野市
1707年重建的國寶本堂高約27公尺，屋脊呈T字形的「撞木造」，是東日本規模最大的木造國寶建築之一。這座不屬任何宗派的寺院供奉一光三尊阿彌陀如來，還可體驗在內陣地下繞行的「戒壇巡禮」。
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園城寺（三井寺）
滋賀縣 大津市
在三井寺可以看到桃山時代宏大的金堂，以及檜皮屋頂優美的新羅善神堂。書院造的勸學院客殿和光淨院客殿可提前申請特別參觀。
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延曆寺
滋賀縣 大津市
由最澄開創的比叡山延曆寺被稱為「日本佛教之母山」，是世界遺產寺院。國寶根本中堂是位於東塔的總本堂，本尊前供奉著據說已燃燒1200年的「不滅法燈」。
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石山寺
滋賀縣 大津市
在石山寺，可以看到兩座國寶：禮堂伸出在矽灰石岩盤上的平安時代本堂，以及建於1194年、在年代明確的多寶塔中最古老的多寶塔。寺內還有相傳紫式部開始寫作《源氏物語》的「源氏之間」。
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寶嚴寺
滋賀縣 長濱市
在寶嚴寺，可以看到被認為可能是秀吉大坂城唯一現存建築而備受關注的國寶唐門、懸造式的觀音堂，以及通往都久夫須麻神社的舟廊下。供奉本尊大弁才天的本堂需沿石階登上。
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西本願寺
京都府 京都市
這裡是由親鸞聖人的廟堂發展而來的淨土真宗本願寺派本山。巨大的御影堂和阿彌陀堂、布滿雕刻的唐門、飾有金碧障壁畫的書院、現存最古老的北能舞台、三層的飛雲閣等8棟國寶建築匯集於此。
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三寶院
京都府 京都市
在三寶院，可以看到吸收了寢殿造樣式的國寶表書院，以及黑漆襯托金色紋章的國寶唐門。表書院前是豐臣秀吉為「醍醐賞花」親自進行基本設計的特別名勝庭園。
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醍醐寺
京都府 京都市
在醍醐寺，可以在下醍醐看到被視為京都府最古老木造建築的五重塔和金堂，在山上的上醍醐看到藥師堂和懸造式的清瀧宮拜殿。寺方稱國寶建築共有6棟，其中三寶院的2棟在三寶院頁面介紹。
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大德寺
京都府 京都市
在大德寺，可以漫步於伽藍南北排列的禪宗寺院境內，以及眾多塔頭之間。擁有國寶方丈、玄關和桃山時代唐門的本坊通常不對外開放，只能從外面觀看伽藍的布局。
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東寺（教王護國寺）
京都府 京都市
東寺是嵯峨天皇託付給空海的真言密教根本道場，高約55公尺、號稱日本最高木塔的五重塔聳立在京都車站南側。寺內有桃山時代的金堂、室町時代的大師堂等多座國寶建築。
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仁和寺
京都府 京都市
真言宗御室派總本山，由宇多天皇於888年建成，歷代住持多由皇室出身者擔任。國寶金堂是從御所遷來的紫宸殿，可與二王門、五重塔以及晚開的御室櫻一同觀賞。
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南禪寺
京都府 京都市
臨濟宗大本山，起源於龜山法皇將離宮改為禪寺。在國寶方丈中，可以看到從御所遷來的大方丈與小方丈的障壁畫，以及被稱為「虎子渡」的枯山水庭園。
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慈照寺（銀閣寺）
京都府 京都市
室町幕府第8代將軍足利義政在東山山莊興建的觀音殿（銀閣）和持佛堂東求堂皆為國寶。銀閣以金閣為範本卻不事雕飾，與義政親自參與營造的庭園一起，保留著東山文化的韻味。
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知恩院
京都府 京都市
知恩院是淨土宗的總本山，坐落在與開山祖師法然上人淵源深厚之地。這裡可以看到兩棟江戶時代前期的國寶大型建築：日本規模最大級的木造山門三門，以及供奉法然上人御影的御影堂。
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東福寺
京都府 京都市
在東福寺，可以看到被視為現存最古老、最大的禪宗三門的國寶三門，以及樓上的佛像和天花板畫。還可以一併參觀中世的禪堂和東司、重森三玲設計的方丈庭園，以及楓紅名勝通天橋。
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妙法院與三十三間堂
京都府 京都市
三十三間堂的本堂南北長約120公尺，堂內階梯式排列著1001尊千手觀音立像，建築於1266年重建，是鎌倉時代的國寶。擁有本堂的妙法院，其桃山時代的庫裡也被指定為國寶。
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清水寺
京都府 京都市
清水寺本堂於1633年重建，以18根櫸木柱在音羽山坡上撐起舞台，是採用「懸造」工法的國寶。可以在舞台上俯瞰京都街景，也可以從下方仰望不用一根釘子的木構架。清水寺是世界遺產「古都京都的文化財」之一。
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萬福寺
京都府 宇治市
由隱元禪師開創的黃檗宗大本山，按中國明代樣式建造的天王殿、大雄寶殿、法堂3棟國寶建築排成一條直線。可以看到柚木建造的本堂和黃檗天井等其他寺院少見的設計。