平安 · 寺院 · 国宝
中尊寺
岩手县 平泉町
金色堂由奥州藤原氏初代藤原清衡于1124年建造，内阵以夜光贝螺钿和金箔装饰，供奉阿弥陀如来，须弥坛中长眠着藤原氏四代。这是唯一保留中尊寺创建时原貌的建筑。
桃山 · 寺院 · 国宝
瑞岩寺
宫城县 松岛町
在瑞岩寺，可以在伊达政宗于1609年建成的国宝本堂中，观赏饰有隔扇画的各个房间和御成玄关；在相邻的国宝库里，则可看到雄浑的唐草雕刻和设有排烟楼的大屋顶。
室町 · 寺院 · 国宝
羽黑山五重塔
山形县 鹤冈市
这座高29米余的五重塔不施彩绘、保留原木本色，矗立在羽黑山杉树林立、石阶绵延的表参道上。塔建于1372年，与出羽三山信仰之山的参道景色融为一体。
江户 · 寺院 · 国宝
轮王寺大猷院
栃木县 日光市
在轮王寺大猷院，可以看到作为德川第三代将军家光庙所而建、以金色和黑色为基调的国宝灵庙（拜殿·相之间·本殿），以及依次穿过仁王门、二天门、夜叉门的参道。境内排列着315座灯笼，在灵庙内部还能看到狩野探幽的唐狮子和天花板上的龙图。
室町 · 寺院 · 国宝
圆觉寺
神奈川县 镰仓市
在圆觉寺，可以看到以扇椽屋檐之美著称的禅宗样舍利殿（国宝），以及关东最大梵钟、国宝洪钟。寺方的活动日程中，每年安排三次舍利殿特别公开。
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瑞龙寺
富山县 高冈市
在瑞龙寺，可以漫步于总门、山门、佛殿、法堂排成一直线并以回廊相连的江户初期禅宗伽蓝。国宝为文政元年重建、高约18米的山门，覆铅瓦的佛殿，以及供奉前田利长牌位的法堂共3栋。
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善光寺
长野县 长野市
1707年重建的国宝本堂高约27米，屋脊呈T字形的“撞木造”，是东日本规模最大的木造国宝建筑之一。这座不属任何宗派的寺院供奉一光三尊阿弥陀如来，还可体验在内阵地下绕行的“戒坛巡礼”。
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园城寺（三井寺）
滋贺县 大津市
在三井寺可以看到桃山时代宏大的金堂，以及桧皮屋顶优美的新罗善神堂。书院造的劝学院客殿和光净院客殿可提前申请特别参观。
江户 · 寺院 · 国宝
延历寺
滋贺县 大津市
由最澄开创的比叡山延历寺被称为“日本佛教之母山”，是世界遗产寺院。国宝根本中堂是位于东塔的总本堂，本尊前供奉着据说已燃烧1200年的“不灭法灯”。
平安 · 寺院 · 国宝
石山寺
滋贺县 大津市
在石山寺，可以看到两座国宝：礼堂伸出在硅灰石岩盘上的平安时代本堂，以及建于1194年、在年代明确的多宝塔中最古老的多宝塔。寺内还有相传紫式部开始写作《源氏物语》的“源氏之间”。
桃山 · 寺院 · 国宝
宝严寺
滋贺县 长滨市
在宝严寺，可以看到被认为可能是秀吉大坂城唯一现存建筑而备受关注的国宝唐门、悬造式的观音堂，以及通往都久夫须麻神社的舟廊下。供奉本尊大弁才天的本堂需沿石阶登上。
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西本愿寺
京都府 京都市
这里是由亲鸾圣人的庙堂发展而来的净土真宗本愿寺派本山。巨大的御影堂和阿弥陀堂、布满雕刻的唐门、饰有金碧障壁画的书院、现存最古老的北能舞台、三层的飞云阁等8栋国宝建筑汇集于此。
桃山 · 寺院 · 国宝
三宝院
京都府 京都市
在三宝院，可以看到吸收了寝殿造样式的国宝表书院，以及黑漆衬托金色纹章的国宝唐门。表书院前是丰臣秀吉为“醍醐赏花”亲自进行基本设计的特别名胜庭园。
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醍醐寺
京都府 京都市
在醍醐寺，可以在下醍醐看到被视为京都府最古老木造建筑的五重塔和金堂，在山上的上醍醐看到药师堂和悬造式的清泷宫拜殿。寺方称国宝建筑共有6栋，其中三宝院的2栋在三宝院页面介绍。
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大德寺
京都府 京都市
在大德寺，可以漫步于伽蓝南北排列的禅宗寺院境内，以及众多塔头之间。拥有国宝方丈、玄关和桃山时代唐门的本坊通常不对外开放，只能从外面观看伽蓝的布局。
镰仓 · 寺院 · 国宝
东寺（教王护国寺）
京都府 京都市
东寺是嵯峨天皇托付给空海的真言密教根本道场，高约55米、号称日本最高木塔的五重塔耸立在京都站南侧。寺内有桃山时代的金堂、室町时代的大师堂等多座国宝建筑。
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仁和寺
京都府 京都市
真言宗御室派总本山，由宇多天皇于888年建成，历代住持多由皇室出身者担任。国宝金堂是从御所迁来的紫宸殿，可与二王门、五重塔以及晚开的御室樱一同观赏。
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南禅寺
京都府 京都市
临济宗大本山，起源于龟山法皇将离宫改为禅寺。在国宝方丈中，可以看到从御所迁来的大方丈与小方丈的障壁画，以及被称为“虎子渡”的枯山水庭园。
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慈照寺（银阁寺）
京都府 京都市
室町幕府第8代将军足利义政在东山山庄修建的观音殿（银阁）和持佛堂东求堂均为国宝。银阁以金阁为范本却不事雕饰，与义政亲自参与营造的庭园一起，保留着东山文化的韵味。
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知恩院
京都府 京都市
知恩院是净土宗的总本山，坐落在与开山祖师法然上人渊源深厚之地。这里可以看到两栋江户时代前期的国宝大型建筑：日本规模最大级的木造山门三门，以及供奉法然上人御影的御影堂。
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东福寺
京都府 京都市
在东福寺，可以看到被视为现存最古老、最大的禅宗三门的国宝三门，以及楼上的佛像和天花板画。还可以一并参观中世的禅堂和东司、重森三玲设计的方丈庭园，以及红叶名胜通天桥。
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妙法院与三十三间堂
京都府 京都市
三十三间堂的本堂南北长约120米，堂内阶梯式排列着1001尊千手观音立像，建筑于1266年重建，是镰仓时代的国宝。拥有本堂的妙法院，其桃山时代的库里也被指定为国宝。
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清水寺
京都府 京都市
清水寺本堂于1633年重建，以18根榉木柱在音羽山坡上撑起舞台，是采用“悬造”工法的国宝。可以在舞台上俯瞰京都街景，也可以从下方仰望不用一根钉子的木构架。清水寺是世界遗产“古都京都的文化财”之一。
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万福寺
京都府 宇治市
由隐元禅师开创的黄檗宗大本山，按中国明代样式建造的天王殿、大雄宝殿、法堂3栋国宝建筑排成一条直线。可以看到柚木建造的本堂和黄檗天井等其他寺院少见的设计。